Food Chemistry, Год журнала: 2025, Номер unknown, С. 144047 - 144047
Опубликована: Март 1, 2025
Язык: Английский
Food Chemistry, Год журнала: 2025, Номер unknown, С. 144047 - 144047
Опубликована: Март 1, 2025
Язык: Английский
Nature, Год журнала: 2025, Номер 638(8052), С. 901 - 911
Опубликована: Фев. 26, 2025
Язык: Английский
Процитировано
2Computational and Structural Biotechnology Journal, Год журнала: 2025, Номер 27, С. 832 - 842
Опубликована: Янв. 1, 2025
Язык: Английский
Процитировано
1bioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory), Год журнала: 2025, Номер unknown
Опубликована: Фев. 7, 2025
The integration of genetic and chemical perturbations has driven transformative advances in elucidating cellular mechanisms accelerating drug discovery. However, the lack a unified representation for diverse perturbagen types limits comprehensive analysis joint modeling multi-domain perturbation agents (molecular cause space) their resulting phenotypes (phenotypic effect spaces). Here, we present UniPert, hybrid deep learning framework that encodes perturbagens into shared semantic space. UniPert employs tailored encoders to address inherent molecular-scale differences across leverages contrastive with experiment-driven compound-target interactions bridge these domains. Extensive experiments validate UniPert’s versatility application. generated representations effectively capture hierarchical pharmacological relationships perturbagens, facilitating annotations understudied targets compounds. can be plugged advanced frameworks enhance performance both outcome prediction tasks. Notably, paves way cross-domain modeling, driving novel genetic-to-chemical transfer paradigm, boosting context-specific silico screening efficiency development personalized therapies.
Язык: Английский
Процитировано
0Current Cardiology Reports, Год журнала: 2025, Номер 27(1)
Опубликована: Фев. 19, 2025
Язык: Английский
Процитировано
0Cell Research, Год журнала: 2025, Номер unknown
Опубликована: Март 25, 2025
Язык: Английский
Процитировано
0Food Chemistry, Год журнала: 2025, Номер unknown, С. 144047 - 144047
Опубликована: Март 1, 2025
Язык: Английский
Процитировано
0