FEMS Microbiology Ecology,
Год журнала:
2024,
Номер
unknown
Опубликована: Дек. 24, 2024
Abstract
The
gut
microbiota,
which
includes
prokaryotes,
archaea,
and
eukaryotes
like
yeasts,
some
protozoa,
fungi,
significantly
impact
fish
by
affecting
digestion,
metabolism,
the
immune
system.
In
this
research,
we
combine
various
tasks
carried
out
bacteria
in
of
fish.
This
study
also
examines
microbiome
composition
marine
freshwater
fish,
identifying
important
bacterial
species
linked
to
different
biological
functions.
diversity
within
highlights
importance
considering
nutrition,
habitat,
environmental
factors
microbiological
research
on
ever-changing
indicates
that
microbial
communities
are
specifically
adapted
meet
needs
both
host
its
environment.
can
adjust
a
specific
environment
with
help
microbiota.
is
crucial
for
comprehending
complex
relationships
between
their
aquatic
environments.
These
discoveries
have
implications
aquaculture
practices,
fisheries
administration,
broader
ecological
processes
With
further
progress
area
study,
knowledge
acquired
would
offer
valuable
standpoint
enhance
our
comprehension
microbiology
sustainability
nutrition
resources.
Bulletin of Sumy National Agrarian University The series Veterinary Medicine,
Год журнала:
2025,
Номер
3(66), С. 41 - 46
Опубликована: Янв. 6, 2025
Esox
Lucius
щука
звичайна
належить
до
царства
тварин,
типу
хордові,
ряду
щукоподібні,
родина
щукові,
рід
щука,
а
вид
щука.
При
дослідженні
будови
щуки
звичайної
та
риб
в
цілому
першу
чергу
звертаємо
увагу
на
зовнішній
абрис
цієї
особини.
Для
абрису
тіла
користувалися
тримірним
виміром,
щоб
візуально
уявляти
розташування
анатомічних
складових
відносно
трьох
площин.
Щука
це
риба
річкова,
її
форма
стрілоподібне,
витягнуте
по
довжині,
допомагає
цій
рибі
швидко
рухатись,
або
навпаки
стояти
мілині
охоті.
Довжина
може
досягати
півтора
метра,
вага
тридцяти
кілограмів.
На
тілі
розрізняють
ділянку
голови,
тулуб,
плавці
хвіст.
Ці
основні
анатомічні
складові
і
відрізняють
різні
види
риб.
Колір
темно
сірий
з
сріблястим
відтінком.
протязі
всього
шкіра
вкрита
кістковою
лускою,
заходить
головну
ділянку,
потиличну
зяброву
кришку
косими
рядками
заходячи
одна
за
одну,
спина
темніша
ніж
черево,
тулубі
видні
світлі
плями
різного
розміру
розташовані
вздовж
впоперек
тіла.
Ділянка
голови
у
велика,
займає
майже
одну
третю
всієї
рибини,
гарно
розвинена,
приплюснута
дорсовентрально,
починається
ротовим
отвором.
має
добре
розвинені
парні
непарні
плавці.
Непарні
спинний,
анальний
хвостовий.
Хвостовий
розділений
дві
частини,
плямисте
забарвлення.
великій
головній
ділянці
рот,
носові
отвори,
зяброві
отвори
очі.
Починається
ділянка
орально
великим
отвором,
який
тягнеться
аж
переднього
края
ока.
Ротовий
отвір
утворений
двома
щелепами
верхньою
нижньою,
кут
рота
вони
формують
доходить
рострального
краю
очей.
Мандібуля
виступає
трохи
вперед
верхню
щелепу.
верхньощелепній
кістці
аборально
розміщена
шкірна
складка,
яка
з’єднує
черепом
обмежує
бічні
стінки
ротової
порожнини,
чим
зумовлений
спосіб
живлення
щук.
Очні
яблука
дорсолатерально
мають
шароподібну
форму,
не
повік.
Отвір
райдужної
оболонки
великий
круглу
форму.
По
краям
ока
складка
зрощена
ростральною
стінкою
Аборально
розташована
зяброва
прикрита
зябровою
кришкою.
Від
заднього
широка
нижньої
щелепи
назву
перетинка.
Разом
обмежують
щілину,
які
з’єднуються
один
одним
правого
лівого
боків.
Рострально
від
очей
знаходиться
вхід
носову
порожнину.
Він
представлений
парами
ніздрів
різної
форми,
назальний
форму
круга,
аборальний
півмісяця.
Прямо
під
цими
отворами
є
порожнина
яку
через
ніздрі
потрапляє
вода
коли
рухається,
таким
чином
відбувається
зміна
води
нюховій
капсулі.
Ротова
великою
ротовою
щілиною,
обмежена
нерухомими
губами.
Закінчується
ротова
глоткою.
Як
похідні
органів
головної
кишки
тут
зуби
язик.
Форма
зубів
конусовидна,
більші
розміщуються
нижній
щелепі.
верхній
щелепі
піднебінні
дрібні
чисельні.
Frontiers in Microbiology,
Год журнала:
2025,
Номер
15
Опубликована: Янв. 7, 2025
Understanding
the
diversity
and
function
of
fish
gut
microbiomes
has
advanced
substantially,
yet
many
aspects
remain
poorly
understood,
particularly
interplay
among
microbiota,
host
species,
environmental
factors
in
context
conservation.
This
review
explores
composition
abundance
bacterial
communities
key
aquaculture
groups-cyprinids,
ictalurids
(catfish),
salmonids,
cichlids
(tilapia)-alongside
model
organism
zebrafish,
across
diverse
geographic
regions.
The
findings
highlight
habitats
species
as
primary
determinants
microbiome
structure,
offering
a
global
perspective
on
these
microbial
communities.
Across
all
groups,
phyla
Firmicutes,
Fusobacteria,
Proteobacteria
consistently
dominated,
while
temperate,
sub-equatorial,
sub-tropical
regions
exhibited
highest
diversity,
underscoring
contribution
taxonomic
factors.
farm-raised
shows
significant
divergence
from
that
wild-caught
fish,
reflecting
impacts
ecological
management
differences.
dynamic
responses
microbiota
is
vital
for
guiding
conservation
efforts,
safeguarding
aquatic
biodiversity,
advancing
sustainable
practices.
Future
research
should
leverage
innovative
techniques
integrative
approaches,
both
experimental
theoretical,
to
uncover
functional
roles
predict
their
changes.
Expanding
coverage
will
be
critical
creating
comprehensive
framework
inform
strategies.
Collectively,
this
highlights
transformative
potential
addressing
challenges
biology.
Microbiology Spectrum,
Год журнала:
2025,
Номер
unknown
Опубликована: Март 14, 2025
ABSTRACT
The
microbiota
composition
of
healthy
farmed
fishes
remains
poorly
characterized
for
many
species.
This
study
explores
the
influence
external
environment
and
innate
factors
that
may
shape
gut
Asian
seabass,
Lates
calcarifer
.
α-diversity
based
on
Shannon,
Simpson,
Chao1
indices
was
lower
reared
in
sea
cages
tanks
than
experienced
a
transfer
from
to
tanks.
Longitudinal
analyses
segments
revealed
no
significant
differences
alpha
diversity
between
within
same
containment
type,
except
index
stomach
pyloric
cecum
sea-caged
fishes.
β-diversity
analysis
using
weighted
UniFrac
distance
Bray-Curtis
dissimilarity
demonstrated
fish
type
shared
similar
microbial
communities.
PERMANOVA
tests
confirmed
farm,
batch
significantly
influenced
these
distances.
Containment
accounted
10.4%
observed
diversity,
farm
29.8%,
10.7%.
Genera
comprising
potential
pathogens
such
as
Aeromonas
,
Flavobacterium
Vibrio
were
differentially
abundant
along
guts
different
types
particularly
increased
Microbiota
changes
with
host
age
segment,
genera
identified
seabass
grew.
Comparing
hindgut
other
species
host-specific
clustering
indicated
by
PERMANOVA.
Overall,
findings
underscore
significance
conditions
broad
implications
aquaculture
practices.
IMPORTANCE
Understanding
is
crucial
optimizing
highlights
(
).
By
demonstrating
community
are
shaped
location,
batch,
research
provides
valuable
insights
into
how
environmental
interact
health.
findings,
differential
abundance
various
types,
need
tailored
management
strategies
aquaculture.
not
only
advances
our
knowledge
but
also
has
improving
sustainability
productivity
Frontiers in Microbiology,
Год журнала:
2025,
Номер
16
Опубликована: Март 28, 2025
Marine
heterotrophic
bacteria
in
coastal
waters
respond
to
the
influx
of
carbon
from
natural
and
anthropogenic
sources.
We
identified
two
nearly
identical,
(99.9%
average
nucleotide
identity;
100%
amino
acid
same
DNA
G
+
C
content
52.3
mol%)
high-quality
(≥99%
CheckM
completeness
≤
1.3%
contamination)
draft
metagenome-assembled
genomes
(MAGs;
SJ0813
SJ0972)
seawater
microbiomes
a
southern
island
Singapore
that
is
protected
marine
park.
The
MAGs
were
only
assigned
Cellvibrionaceae
family
according
Genome
Taxonomy
Database.
Overall
genome
related
indices
Pseudomaricurvus
alkylphenolicus
KU41GT
as
closest
phylogenetic
relative
revealed
no
more
than
70.45%
identity
(ANIcutoff
<
95%),
below
50%
percentage
conserved
proteins
(POCPcutoff
=
43.54%)
for
genera
cutoff
low
digital
DNA-DNA
hybridization
values
(DDH
20.6
20.8%).
major
respiratory
quinone
predicted
be
ubiquinone-9
annotation
3-demethylubiquinone-9
3-methyltransferase
(ubiG,
K00568)
involved
last
step
ubiquinone
biosynthesis
pathway
(M00117),
which
differed
ubiquinone-8
utilized
by
known
members
Cellvibrionaceae.
Both
contained
complete
dissimilatory
nitrate
reduction
ammonia,
increases
bioavailability
nitrogen
seawater.
An
identical
choline
dehydrogenase
found
both
have
amino-acid
(≤64.47%)
compared
existing
GMC
oxidoreductases,
expanding
on
diversity
this
enzymes.
meet
all
minimum
requirements
but
lack
16S
rRNA
gene
sufficient
length
required
proposed
novel
genus
species
under
SeqCode.
Nevertheless,
trees
based
core-genome
RpoB
an
alternative
marker
are
congruent
with
taxon
standing
monophyletic
clade
other
taxa
order
Cellvibrionales.
Taken
together,
(SJ0813
represent
uncultured,
undescribed
we
tentatively
propose
name
Candidatus
Pelagadaptatus
aseana
gen.
nov.,
sp.
nov.
strain
SJ0813TS
(=BAABNI000000000.1TS)
type
sequence.
Phylogenetic
inference
placed
Umboniibacter
marinipuniceus
KMM
3891T
outside
We,
therefore,
transfer
new
Umboniibacteraceae
International
Code
Nomenclature
Prokaryotes.
Environmental Microbiome,
Год журнала:
2025,
Номер
20(1)
Опубликована: Март 31, 2025
Abstract
Background
The
pondwater
microbiome
is
believed
to
play
a
key
role
in
fish
health,
including
shaping
mucosal
surface
microbiomes
that
help
protect
against
disease.
How
different
physiochemical
features
relating
season,
geographical
locations,
as
well
crop
species
shape
the
pond
water
finfish
aquaculture
system,
not
established.
Pangasius
(
Pangasianodon
hypophthalmus
)
and
tilapia
Oreochromis
niloticus
are
two
of
most
widely
farmed
disease
major
impediment
expansion
their
production.
We
applied
16S
18S
rRNA
metabarcoding
assess
how
physicochemistry
location
pangasius
earthen
ponds
Bangladesh.
Results
Planctomycetota,
Pseudomonadota
Actinomycetota
were
dominant
bacterial
phyla
while
Stramenopiles
Alveolata
microeukaryotes
(divisions)
water.
relative
abundance
Planctomycetota
was
higher
compared
with
ponds,
Actinomycetota,
relatively
ponds.
Tilapia
also
exhibited
microbial
diversity
at
its
lowest
winter
(and/or
monsoon)
highest
pre-monsoon
period.
community
structures
differed
across
seasons,
culture
systems,
species,
season
locations
showing
strongest
effects.
Of
assessed,
temperature
pH
found
have
weak
but
significant
effect
on
content
for
both
shared
over
46%
ASVs,
around
30%
ASVs
study
locations.
Conclusion
Our
findings
demonstrate
communities
systems
Bangladesh
shaped
by
location,
effects
from
physicochemistry.
results
provide
insights
into
dynamic
nature
environmental
influences
may
be
use
management
improving
productivity
enhancement
overall
health.
Graphical
Animals,
Год журнала:
2024,
Номер
14(12), С. 1792 - 1792
Опубликована: Июнь 14, 2024
Extracellular
vesicles
(EVs)
are
functional
substances
secreted
by
microbes
and
host
cells,
it
has
been
discovered
that
they
participate
in
the
interactions
between
different
microorganisms.
Our
recent
findings
indicate
Limosilactobacillus
reuteri-derived
EVs
have
potential
to
improve
intestinal
microbiota
of
Oplegnathus
fasciatus
fish
inhibit
pathogenic
bacteria.
Previous
research
reported
cells
play
a
regulatory
role
microbiota.
This
suggested
investigate
mechanisms
through
which
L.
regulate
microbiota,
system
excludes
interference
from
should
be
established.
In
this
study,
an
vitro
cultured
bacteria
system,
without
factors,
was
used
simulate
O.
fish.
After
adding
changes
were
analyzed.
The
results
showed
effectively
reduced
abundance
Vibrio
spp.
experiments,
also
observed
ability
alginolyticus.
We
further
sequenced
small
RNA
contained
found
these
RNAs
can
interfere
with
genes
(LysR,
pirin,
MIpA/OmpV,
CatB,
aspartate-semialdehyde
dehydrogenase)
related
growth
V.
Taken
together,
absence
involvement,
present
function
inhibiting
exhibit
Bulletin of Sumy National Agrarian University The series Veterinary Medicine,
Год журнала:
2024,
Номер
1(64), С. 47 - 52
Опубликована: Июнь 19, 2024
Риби
відносяться
до
царства
тварин,
водних
хребетних
ряд
коропоподібні,
родина
коропові,
вид
карась
звичайний.
Скелет
риб
складається
з
осьового
скелету
тулуба,
органів
руху
плавців
(скелет
кінцівок)
та
черепа.
Осьовий
скелет
карася
має
два
відділи
тулубовий
хвостовий.
Основу
його
складає
хребетний
стовбур
утворений
кістковими
хребцями,
які
з’єднані
між
собою,
а
в
тулубовому
відділі
є
ребра,
розташовані
по
бокам
і
захищають
внутрішні
органи
риби.
В
результаті
наших
досліджень
були
встановлені
особливості
будови
форми
тіла
звичайного.
При
цьому
застосовували
комплекс
стандартних
морфологічних
методів
досліджень.
Використовували
комплексні
класичні
морфологічні,
анатомічні
методи
експериментальних
досліджень,
включали:
зовнішній
огляд
досліджуваного
об'єкта,
препарування
органів,
їх
абрис
(колір,
консистенція,
форма),
виявлення
топографічних
особливостей
урахуванням
опису
організму
контурах,
фотографували
його,
що
кінцевому
підсумку
дозволило
провести
ретельне
макроскопічне
дослідження
соматичної
системи
у
карасів.
Будова
звичайного
білатерально
симетрична
для
інших
ми
використовуємо
тримірний
вимір,
тобто
відносно
трьох
площин.
Тіло
гарно
розвинену
головну
ділянку,
спинку
легким
вигином,
приплюснуту
вентральну
частину
тулуба
розвинений
хвіст.
Колір
карасів
коливається
від
сріблясто-жовтого
бронзового
залежності
роду.
Окрас
більш
темніший
дорсальній
частині
ніж
вентральній.
Карась
тіло
На
головній
ділянці
розрізняють
рот,
парні
носові
отвори,
зяброві
отвори
очі.
хвіст
ззовні
вкриті
кістковою
лускою,
яка
щільно
прилягають
один
одного,
вентрально
за
головною
ділянкою
формується
щільніша
пластинка
луски
грудних
латеромедіально.
тілі
видно
безперервну
шкірну
складку
медіальній
лінії
дорсально
вздовж
спини,
потім
вона
переходить
анального
отвору
утворює
непарні
плавці.
Від
Основна
функція
це
регуляція
риби
певному
порядку
напрямку,
підтримка
рівноваги
воді.
Плавці
спинний,
хвостовий
анальний,
грудні
черевні.
спинці
розташований
непарний
спинний
плавець,
він
довгий,
зменшується
бік
хвоста,
перші
промені
тверді
перший
зазубрени
на
каудальном
краї.
Хвостовий
плавець
вигляд
оберненої
трапеції,
дві
лопасті,
ним
закінчується
хвостова
ділянка.
Парний
грудний
розташовується
каудально
зябрових
отворів
бокам,
вентральніше
виступають
черевні
плавці,
лежать
горизонтально.
Анальний
плавец
межі
розгалужені.
голови
розташована
розвинена
парна
зяброва
щілина
права
ліва.
Вона
вертикально
її
нижній
кінець
доходить
майже
кута
губ,
аборально
формує
межу
голови.
Її
прикриває
кришка
бічну
поверхню