A Functional Switch Between Asperfumene and Fusicoccadiene Synthase and Entrance to Asperfumene Biosynthesis through a Vicinal Deprotonation‐Reprotonation Process
Angewandte Chemie International Edition,
Год журнала:
2024,
Номер
63(38)
Опубликована: Июль 1, 2024
The
diterpene
synthase
AfAS
was
identified
from
Aspergillus
fumigatiaffinis.
Its
amino
acid
sequence
and-according
to
a
structural
model-active
site
architecture
are
highly
similar
those
of
the
fusicocca-2,10(14)-diene
PaFS,
but
produces
structurally
much
more
complex
with
novel
6-5-5-5
tetracyclic
skeleton
called
asperfumene.
cyclisation
mechanism
elucidated
through
isotopic
labelling
experiments
and
DFT
calculations.
reaction
cascade
proceeds
in
its
initial
steps
intermediates
as
for
PaFS
cascade,
then
diverges
an
unusual
vicinal
deprotonation-reprotonation
process
that
triggers
skeletal
rearrangement
at
entrance
leading
unique
asperfumene
skeleton.
model
revealed
only
one
major
difference
between
active
sites:
residue
F65
is
substituted
by
I65
AfAS.
Intriguingly,
site-directed
mutagenesis
both
synthases
position
65
serves
bidirectional
functional
switch
biosynthesis
versus
less
diterpenes.
Язык: Английский
Experiment Meets Theory: Cope Rearrangements and Thermal E/Z Isomerisations of Terpenoid Hydrocarbons
European Journal of Organic Chemistry,
Год журнала:
2024,
Номер
unknown
Опубликована: Авг. 12, 2024
Abstract
Several
terpenes
are
known
that
can
undergo
a
Cope
rearrangement.
Prominent
examples
include
germacrene
A
and
hedycaryol
show
rearrangement
already
slightly
above
room
temperature.
In
the
present
study
rearrangements
of
several
eventually
co‐occurring
thermal
E
/
Z
isomerisations
were
investigated
experimentally
for
their
minimum
required
temperatures
states
equilibrium.
The
experimental
findings
supported
by
computational
assessments
free
activation
energies
(ΔG
≠
)
as
well
relative
Gibbs
reactants
(ΔG).
Язык: Английский
Skeletal Rearrangements in the Enzyme‐Catalysed Biosynthesis of Coral‐type Diterpenes from Chitinophaga pinensis
Angewandte Chemie International Edition,
Год журнала:
2024,
Номер
63(50)
Опубликована: Авг. 28, 2024
Abstract
Two
diterpene
synthases
from
the
bacterium
Chitinophaga
pinensis
were
characterised.
The
first
enzyme
mainly
produced
rearranged
palmatol,
a
compound
known
octocorals,
while
second
made
new
coral‐type
eunicellane
chitinol.
mechanisms
of
both
enzymes
deeply
studied
through
isotopic
labelling
experiments,
DFT
calculations,
and
with
substrate
analog
containing
saturated
double
bond,
resulting
in
formation
derailment
products
that
gave
additional
insights
into
nature
cyclisation
cascade
intermediates.
diterpenes
poses
interesting
questions
on
functions
these
compounds
organisms
as
different
bacteria
corals.
Язык: Английский
Skeletal Rearrangements in the Enzyme‐Catalysed Biosynthesis of Coral‐type Diterpenes from Chitinophaga pinensis
Angewandte Chemie,
Год журнала:
2024,
Номер
136(50)
Опубликована: Авг. 28, 2024
Abstract
Zwei
Diterpensynthasen
aus
dem
Bakterium
Chitinophaga
pinensis
wurden
charakterisiert.
Das
erste
Enzym
produzierte
hauptsächlich
das
umgelagerte
Diterpen
Palmatol,
eine
Oktokorallen
bekannte
Verbindung,
während
zweite
neue
korallenartige
Eunicellan
Chitinol
herstellte.
Die
Mechanismen
beider
Enzyme
durch
Isotopenmarkierungsexperimente,
DFT‐Berechnungen
und
mit
einem
Substratanalogon,
gesättigte
Doppelbindung
enthält,
eingehend
untersucht.
Letzteres
führte
zur
Bildung
von
Abbruchprodukten
führte,
die
zusätzliche
Einblicke
in
Natur
der
Intermediate
Cyclisierungskaskade
lieferten.
korallenartiger
Diterpene
wirft
interessante
Fragen
zu
den
Funktionen
dieser
Verbindungen
so
unterschiedlichen
Organismen
wie
Bakterien
Korallen
auf.
Ein funktioneller Wechsel zwischen Asperfumen‐ und Fusicoccadien‐Synthase und Eintritt in die Asperfumen‐Biosynthese durch einen vicinalen Deprotonierungs‐Reprotonierungsprozess
Angewandte Chemie,
Год журнала:
2024,
Номер
136(38)
Опубликована: Июль 1, 2024
Abstract
Die
Diterpensynthase
AfAS
wurde
aus
Aspergillus
fumigatiaffinis
identifiziert.
Ihre
Aminosäuresequenz
und
–
einem
Strukturmodell
zufolge
die
Architektur
des
aktiven
Zentrums
sind
denen
der
Fusicocca‐2,10(14)‐dien‐Synthase
PaFS
sehr
ähnlich,
produziert
jedoch
ein
strukturell
viel
komplexeres
Diterpen
mit
neuartigen
6–5–5–5
tetracyclischen
Gerüst
namens
Asperfumen.
Der
Cyclisierungsmechanismus
von
durch
Isotopenmarkierungsexperimente
DFT‐Rechnungen
aufgeklärt.
Reaktionskaskade
verläuft
in
ihren
ersten
Schritten
über
ähnliche
Intermediate
wie
PaFS‐Kaskade,
divergiert
dann
aber
einen
ungewöhnlichen
vicinalen
Deprotonierungs‐Reprotonierungsprozess,
eine
Skelettumlagerung
am
Startpunkt
Stufen
auslöst,
zum
einzigartigen
Asperfumen‐Gerüst
führen.
Das
zeigte
nur
wesentlichen
Unterschied
zwischen
den
Zentren:
PaFS‐Rest
F65
ist
I65
ersetzt.
Interessanterweise
zeigten
ortsspezifische
Mutageneseexperimente
beiden
Diterpensynthasen,
dass
Position
65
als
bidirektionaler
funktioneller
Schalter
für
Biosynthese
tetracyclischem
Asperfumen
im
Vergleich
zu
weniger
komplexen
Diterpenen
dient.