Reagent Engineering for Group Transfer Biocatalysis DOI Creative Commons
John H. Reed, Florian P. Seebeck

Angewandte Chemie, Год журнала: 2023, Номер 136(7)

Опубликована: Сен. 9, 2023

Abstract Biocatalysis has become a major driver in the innovation of preparative chemistry. Enzyme discovery, engineering and computational design have matured to reliable strategies development biocatalytic processes. By comparison, substrate received much less attention. In this Minireview, we highlight idea that synthetic reagents may be an equally fruitful complementary approach develop novel enzyme‐catalysed group transfer This Minireview discusses key examples from literature illustrate how substrates can devised improve efficiency, scalability sustainability, as well scope such reactions. We also provide opinion concept might further developed future, aspiring replicate evolutionary success story natural reagents, adenosine triphosphate (ATP) S ‐adenosyl methionine (SAM).

Язык: Английский

Lernen aus Protein‐Engineering durch Dekonvolution von Multi‐Mutationalen Enzymvarianten** DOI Creative Commons
Frank Hollmann,

Joaquin Sanchis,

Manfred T. Reetz

и другие.

Angewandte Chemie, Год журнала: 2024, Номер 136(36)

Опубликована: Июнь 17, 2024

Abstract Diese Übersicht analysiert eine Entwicklung in der Biochemie, Enzymologie und Biotechnologie, die ursprünglich als Überraschung betrachtet wurde. Nach Etablierung gerichteten Evolution stereoselektiver Enzyme organischen Chemie wurde das Konzept partiellen oder vollständigen Dekonvolution selektiver multi‐mutationaler Varianten eingeführt. Frühe Dekonvolutionsexperimente von stereoselektiven Enzymvarianten führten zu Erkenntnis, dass Mutationen kooperativ antagonistisch miteinander interagieren können, nicht nur additiv. Im letzten Jahrzehnt dieses Phänomen allgemeingültig nachgewiesen. In einigen Studien wurden molekulardynamische (MD) quantenmechanische/ molekülmechanische (QM/MM) Berechnungen durchgeführt, um Licht auf den Ursprung Nicht‐Additivität allen Phasen eines evolutionären Aufstiegs werfen. Daten können verwendet werden, einzigartige mehrdimensionale, zerklüftete („rugged“) Fitness‐Pfad‐Landschaften experimentell konstruieren. Sie bieten mechanistische Einblicke, sich traditionellen Fitnesslandschaften erheblich unterscheiden. einem verwandten Bereich haben Biochemiker lange Ergebnis Einführung zwei Punktmutationen Enzym aus mechanistischen Gründen getestet, gefolgt Vergleich mit entsprechenden Doppelmutante sogenannten Doppelmutanten‐Zyklen, additive Effekte zeigten. jüngerer Zeit auch hier kooperative antagonistische nicht‐additive aufgedeckt. Wir schließen Vorschlägen für zukünftige Arbeiten fordern ein einheitliches Gesamtbild Epistasis.

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Chemoenzymatic Synthesis of Plant‐Derived Kavalactone Natural Products by Dynamic Resolution Using a Biosynthetic O‐Methyltransferase Tailoring Enzyme DOI Creative Commons

Simon Rydzek,

Florian M. Guth,

Steffen Friedrich

и другие.

ChemCatChem, Год журнала: 2024, Номер 16(23)

Опубликована: Авг. 26, 2024

Abstract Biosynthetic enzymes have enormous potential for the chemoenzymatic synthesis of natural products and other bioactive compounds. Methyltransferases are promising tools selective enzymatic modification complex structures. This paper describes production, purification biochemical characterization O‐methyltransferase JerF, which catalyzes unique 4‐methoxy‐5,6‐dihydropyranone formation in jerangolid A biosynthesis. Isolation problems had hitherto prevented detailed studies on JerF were solved by fusion to maltose‐binding protein. The differentiation between styryl‐substituted dihydropyrandion enantiomers was investigated. In combination with a spontaneous racemization occurring this type substrates, new dynamic kinetic resolution observed, used enantioselective kavalactone derivatives. an HMT‐based SAM regeneration system, (+)‐kavain, (+)‐11,12‐dimethoxykavain (+)‐12‐fluorokavain prepared 3–4 steps 100 μmol scale overall yields 37–57 % ee s 70–86 %. mutational study based AlphaFold 2 model provided indications active site residues influence performance enzyme that could be targeted engineering future. example illustrates how exceptional activities specificities biosynthetic can exploited development approaches.

Язык: Английский

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Biocatalytic Amino Acid Functionalisation DOI Open Access
Mark Petchey, Pascal Schneider, Lucy A. Harwood

и другие.

ChemMedChem, Год журнала: 2024, Номер unknown

Опубликована: Ноя. 14, 2024

The success of new therapeutic modalities relies on advancements in synthetic chemistry to produce compounds for evaluation throughout the drug discovery process. use non-canonical amino acids (ncAAs) allows properties peptide drugs be modified and optimised beyond defined characteristics 20 proteogenic acids. Synthesis ncAAs can either through a bespoke chemical synthesis, or directly from parent compound - using traditional reagents enzymes achieve desired modification. This review will highlight recent enzymatic functionalisation variety ncAAs.

Язык: Английский

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Ein universeller, kontinuierlicher Assay für SAM‐abhängige Methyltransferasen DOI Creative Commons
Marian J. Menke, Pascal Schneider, Christoffel P. S. Badenhorst

и другие.

Angewandte Chemie, Год журнала: 2023, Номер 135(51)

Опубликована: Ноя. 2, 2023

Abstract Die enzymkatalysierte Funktionalisierung (engl.: late‐stage functionalization (LSF)), wie z. B. die Methylierung von Arzneimittelmolekülen und Leitstrukturen, ermöglicht den direkten Zugang zu wirksameren pharmazeutischen Wirkstoffen (API). S ‐Adenosyl‐ l ‐Methionin‐abhängige Methyltransferasen (MTs) können eine Schlüsselrolle bei der Entwicklung neuer Wirkstoffe spielen, da sie chemo‐ regioselektive O ‐, N ‐ C ‐Atomen katalysieren damit herkömmlichen chemischen Wegen überlegen sind. Um geeignete MTs identifizieren, haben wir einen kontinuierlichen fluoreszenzbasierten Hochdurchsatzassay für SAM‐abhängige entwickelt, das Screening unter Verwendung E. coli Zelllysaten erleichtert. Dieser Assay besteht aus zwei enzymatischen Schritten Umwandlung ‐Homocystein H 2 S, was einer selektiven Fluoreszenzmessung durch Reduktion eines Azidocoumarin‐Sulfidsensors führt. Untersuchung ‐MTs ‐MT bestätigte, dass dieser Bestimmung Methyltransferase‐Aktivität in geeignet ist.

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Reagent Engineering for Group Transfer Biocatalysis DOI Creative Commons
John H. Reed, Florian P. Seebeck

Angewandte Chemie, Год журнала: 2023, Номер 136(7)

Опубликована: Сен. 9, 2023

Abstract Biocatalysis has become a major driver in the innovation of preparative chemistry. Enzyme discovery, engineering and computational design have matured to reliable strategies development biocatalytic processes. By comparison, substrate received much less attention. In this Minireview, we highlight idea that synthetic reagents may be an equally fruitful complementary approach develop novel enzyme‐catalysed group transfer This Minireview discusses key examples from literature illustrate how substrates can devised improve efficiency, scalability sustainability, as well scope such reactions. We also provide opinion concept might further developed future, aspiring replicate evolutionary success story natural reagents, adenosine triphosphate (ATP) S ‐adenosyl methionine (SAM).

Язык: Английский

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